蝦毀…..公司收到國稅局查核通知,最可怕的不是補稅,而是帳目「說不清楚」

2026/08/19

蝦毀…..公司收到國稅局查核通知,最可怕的不是補稅,而是帳目「說不清楚」

前幾年,我們服務的一家傳產公司收到國稅局關於110年的營所稅查核通知。

老闆一開始很緊張:

「我都有報稅,為什麼還會被國稅局要求補資料?」

其實,國稅局查核時看的不只是你有沒有申報,而是每一筆收入、成本、費用,是否能夠被合理說明、被文件證明、被帳務邏輯串起來。

看看貴公司是否也踩到地雷?

這次國稅局要求公司補充的重點,主要集中在以下幾大類:

一、常見地雷-股東往來:公司跟股東之間的錢,要說得清楚

國稅局要求說明股東往來款項,包含:

借款人是誰?
借款日期是何時?
借款用途是什麼?
是否有銀行存摺往來紀錄?

很多公司習慣把股東墊款、公司周轉、老闆個人資金混在一起,但在查核時,這些都可能被要求逐筆說明。

公司帳戶,不是老闆的私人錢包。

二、商品進銷存:成本不是你說多少就多少

國稅局要求公司提示商品進銷存明細表,以及期初、期末存貨明細。

這代表國稅局不只看營收,也會看:

你賣了多少貨?
進了多少貨?
庫存剩多少?
成本結轉是否合理?

若進銷存資料不完整,營業成本就可能被挑戰,甚至影響所得額認定。

三、薪資費用:有報薪資,也要證明「人真的有做事」

本案中,國稅局要求公司提供員工資料表,包含:

姓名
身分證字號
部門別
職稱
工作內容
證照資料
薪資
獎金
伙食費
退休金提撥
勞健保
到任日期
實際給付薪資證明

這代表國稅局會進一步確認:

這些員工是否真實存在?
工作內容是否與公司營業相關?
薪資金額是否合理?
是否有實際付款紀錄?

尤其是家族企業、關係企業、親屬任職的公司,更要特別留意薪資合理性與工作證明。

四、毛利率與淨利率偏低:國稅局會問「為什麼你比同業低?」

這家公司被要求說明:

本期毛利率約 11.76%,較同業標準毛利率偏低。
本期申報淨利率約 0.89%,也低於同業標準淨利率。

國稅局不是只看你有沒有賺錢,而是會拿你的數字跟同業比較。

如果同業普遍毛利率較高,而你的毛利率偏低,就必須說明原因,例如:

市場競爭激烈
低價出清存貨
原物料成本上升
特殊客戶折扣
產品結構改變
景氣下滑
一次性費用增加

重點是,不能只說「生意不好」,而是要拿得出資料佐證。

五、修繕費、交際費、職工福利:費用不是有發票就一定能認列

國稅局也特別要求說明多項費用,例如:

修繕費
交際費
職工福利
交通費
雜項購置
租賃費用分攤

其中像修繕費,如果多為修車支出,就要說明車輛是否供營業使用,並提供修繕報告、車輛資料、使用紀錄等。

交際費、職工福利如果涉及餐費、禮品、打球、招待,也要證明與公司業務有關,而不是老闆個人消費。

有憑證,只是第一步;能證明與營業有關,才是重點。

六、同址兩家公司:租金、水電、管理費如何分攤?

本案中,國稅局也注意到同一地址設有不同公司,因此要求說明:

租賃契約
營業配置圖
使用面積
費用分攤標準

很多企業會有關係企業共用辦公室、共用員工、共用設備的情況。

但只要費用由其中一家公司全部認列,就可能被國稅局要求說明合理性。

我們從這個案件看到一件事:

企業被查核,不一定是做錯事。

但如果資料不完整、帳務不清楚、費用用途說不明白,就容易讓國稅局認為申報內容有疑義。

真正的風險,不是收到通知函。

真正的風險是:

帳上有數字,手上沒證明。
公司有費用,卻說不出用途。
老闆有支出,卻分不清公私。
申報有資料,卻串不起邏輯。

給企業主的提醒

收到國稅局查核通知時,請不要急著害怕,也不要拖到最後一天才處理。

你應該先整理:

銀行紀錄
合約文件
發票憑證
員工資料
薪資給付證明
進銷存明細
費用用途說明
關係企業分攤依據

國稅局查核最重視的,不只是「你有沒有報」,而是「你能不能證明」。

一句話總結:

企業稅務規劃,不是等國稅局來了才開始補破網,而是平常就要把每一筆錢的故事說清楚。同時跟您的會計師做好充分溝通,做好事前的規劃,勿因善小而不為,勿因惡小而為之。

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